La UPAP tiene objetivos vertebrales cuyo fin mayor es el incentivar la identidad nacional de los paraguayos. El Prof. Dr. Gerardo Fogel, Rector de la UPAP, indica que el primer propósito de la universidad es el educar con amplitud, con un multivisionaje que implica educar a los jóvenes para llegar a ese país que todos soñamos.
Otro objetivo de la UPAP, subrayado por el rector, es el de democratizar la educación y la cultura y hacer que todos los jóvenes del país, puedan acceder al derecho de la Educación Superior sin desarraigarse, sin desintegrarse de sus comunidades. De hecho, la UPAP ha llevado la educación a 16 departamentos del país, teniendo sedes y unidades académicas con más de 30.000 alumnos.
Finalmente, otro de los principales objetivos señalado por el rector, es el de promover, incentivar, alentar a la cultura y la identidad nacional. Unir la ciencia, la tecnología, con el arte y la cultura; que se han separado lamentablemente y que hoy, gracias a la UPAP, se han unido nuevamente.